Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms