Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAXBP1Q9Y5B6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms