Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms