Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SH3BP1Q9Y3L3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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