Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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