Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK2Q9UPX8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHANK2Q9UPX8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHANK2Q9UPX8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHANK2Q9UPX8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHANK2Q9UPX8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHANK2Q9UPX8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHANK2Q9UPX8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms