Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC8A2Q9UPR5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms