Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms