Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms