Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS11EQ9UL52 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms