Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms