Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms