Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms