Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABI3Q9P2A4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms