Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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