Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL28Q9NXS3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms