Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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