Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG7

SIRT3, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT3Q9NTG7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIRT3Q9NTG7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms