Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms