Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms