Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms