Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms