Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPJQ9HC77 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms