Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms