Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIFKQ9BYG3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms