Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RSPO3Q9BXY4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms