Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms