Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms