Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms