Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFXN2Q96NB2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFXN2Q96NB2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms