Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms