Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms