Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms