Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms