Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms