Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PHF3Q92576 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PHF3Q92576 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PHF3Q92576 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PHF3Q92576 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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