Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms