Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPBP1Q92547 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPBP1Q92547 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms