Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms