Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE22Q8NFJ8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms