Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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ZNF439Q8NDP4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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ZNF439Q8NDP4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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ZNF439Q8NDP4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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ZNF439Q8NDP4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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ZNF439Q8NDP4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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ZNF439Q8NDP4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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