Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMF1Q8NBK3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMF1Q8NBK3 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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