Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms