Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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