Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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