Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFRP1Q8N474 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms