Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPAP2Q8IXW5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms