Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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