Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms