Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms